没有对手的修仙者日益腐朽堕落，终于在随后的岁月里再次受到挑战，此次危机来自修仙者内部。修仙者中的妖族修仙者试图消灭人类修仙者，这些妖物虽然远不如洪荒时代的荒兽来得强大，但他们的数量并不比人类修仙者来得少，而且更可怕的是这些妖族修仙者也掌握了高段的修仙法门。他们团结在通天教主领导的碧游宫周围，影响力不断扩大，开始挑战人类修仙者的统治地位，这也最终导致了阐截两教的大混战，也就是封神之战。
在这一战中，双方都大规模使用了法宝做为辅助，并且对法宝的运用也达到了一个相当成熟的高度。这是因为修仙者从一开始便是将自身的元神和天地元气结合在一起修炼，养成元婴，并对之不断加以焠炼，最后才借助强大元婴重塑肉身，这也就导致了他们肉身的相对脆弱。
在打斗时采用法宝以为辅助，其实就是因为肉体强度不够，必须要避免肉体受到直接攻击，才能保证自身的安全。
相对来说，洪荒强者的肉体便是法宝，他们的元神则是操纵体内庞大能量的siling塔，修者要想拥有强大修为，必须两者并重，缺一不可。而这两者却是修仙者最缺乏的，也就最为修仙者所重视，修仙者所拼命强调的根基，其实就是肉体对元气的承载力和元神的稳固强大，所谓根基不稳，大道难成，有了强悍的肉体和元神，修为才能够一日千里。
试想洪荒时代的诸神，哪个不是身具毁天灭底的威能，这样强大的能量却是存在于一个小小的人类躯体当中，那这个躯体需要多么强悍才能承受这种程度的能量在体内运行啊，而且这么强大的能量，稍微释放一点便可以毁城灭池，自然需要有强大无匹的元神才能将之牢牢掌控，否则这些能量在人体内暴走起来，再强悍的人类只怕也要落个爆体而亡的下场。而修仙者讲求境界，其实就是怕元神修为不足，不能控制体内的能量，导致出现能量暴走的情况，也就是走火入魔，必须小心翼翼的按部就班增长自己的功力。
封神之战中，双方都损失惨重，最终妖族惨败，碧游宫也被摧毁，活着的不是被仙人捉去当了座骑，就是跑到深山老林里躲了起来，还有一些投靠了日益兴盛的佛宗，从此四分五裂，再也不复碧游宫存在时的嚣张气焰。
也是在此战之中，修仙者和凡人同场作战，修仙者的恐怖杀伤力被诠释的淋漓尽致，为了控制修仙者不为非作歹，部分拥有高深修为的修仙者以阐教修仙者为根本，组建天庭，修仙者中修炼有成，能够借助天地元气重塑肉身，转换生命形态的便被称为仙人，并在此基础上划定了五类仙人，天仙，地仙，金仙，灵仙，散仙，此外又增加了飞升入天庭必须要接受雷劫考验的规矩，只有通过考验，达到一定实力的才能受到接引。
