崇祯三年，接替死在任上的张梦鲸出任延绥巡抚。上任以后指挥手下勇将曹文昭先后剿杀了王嘉胤、点灯子、王左挂、白汝学等规模比较大的流寇，颇德皇帝的赏识。
崇祯四年接替被逮捕的杨鹤，出任总督陕西三边军务兼兵部右侍郎。
仅仅一年多的时间，整个陕西境内的贼寇不是被剿灭，就是逃窜至他省，洪承畴威名大震。
崇祯七年接替因为车厢峡招抚贼寇失败、导致其蔓延的陈奇瑜担任五省总督，可谓位高权重。
但自家人知道自家事，随着地位的提升，本来意气风发的洪承畴感觉到压力越来越大，内心苦不堪言。
本以为起自陕西的流贼被剿灭后，剩余的以及逃窜的都是疥癣之患不足为道。没成想贼寇却是日益势大，越剿越多，到如今已经成了气候。
原先的小股贼寇逐渐壮大起来，并且行军作战颇有兵法，尤其以闯王高迎祥部以及射塌天拓养坤部最难对付。
他曾经向皇上上疏，谈及剿杀追逐之难已今非昔比：开始是贼兵畏惧官兵，只要看见官兵旗帜就望风而逃，基本不敢正面接战。如今已经敢于和官兵对峙，并且会诱敌，会埋伏，会用骑兵冲杀。
这其中当然有投贼的官兵教导所致，但也不难看出，贼寇的战斗经验越来越丰富。
其次是追逐之难。
贼兵以骑兵为主，有的甚至一贼双马，阵战不利立刻逃跑。官兵大都是马三步七，就算阵战胜利也只能眼看对方逃窜而追之不及。
再者就是贼兵逃跑后躲进深山老林的据点，依据险要地势坚守。
官兵一是军粮难以为继，二是无法携带攻城器械，很难破敌。因为守着险要地势，攻方宛如攻城一般，没有器械难道凭人命去填吗？
再次就是敌众我寡。
因为持续的干旱，饥民越来越多，很多人抱着都是死，不如死前吃顿饱饭的心态加入贼军。
因为贼军四处劫掠，所以一般不缺粮食。
加入贼兵作战勇敢的往往都能吃的饱，这对已经饿红了眼，已经开始易子相食的饥民来说是致命的诱惑。
现在各个贼头加起来，手下的流贼超过了三十万，而围剿官兵仅仅四万余，并且这种差距越拉越大。
官兵阵亡后很难得到补充，而贼兵则一呼百应，啸聚非常容易，目前的形式已经越来越棘手，甚至有恶化的态势。
这次他在汝州召集部属僚佐召开军事会议，研判当前形式和贼寇动向，部署下一步的方略。
此前他向皇上以及兵部递交了新的作战方案——以四川巡抚，总兵移驻夔门，达州，策应湖广；湖广巡抚，总兵移驻襄阳；郧阳巡抚固守本土；凤阳巡抚北上至亳州，兼顾河南府归德，汝宁；山东巡抚移驻曹州，濮州，防范贼兵南下；山西巡抚移驻蒲州，进援灵宝，陕州；河南巡抚移驻汝宁与南阳之间防御；陕西巡抚移驻商州，策应兴安，汉中；此方案的目的就是四面围堵，争取将贼寇驱赶并彻底剿杀与河南境内。
